Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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