Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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CNTN1Q12860 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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CNTN1Q12860 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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CNTN1Q12860 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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CNTN1Q12860 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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CNTN1Q12860 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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CNTN1Q12860 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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