Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms