Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms