Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms