Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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