Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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PDK4Q16654 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDK4Q16654 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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