Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNAPC1Q16533 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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