Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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