Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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NEDD8Q15843 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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