Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Length 100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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