Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SMAD1Q15797 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.5 ms