Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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HMGN3Q15651 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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HMGN3Q15651 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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HMGN3Q15651 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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HMGN3Q15651 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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HMGN3Q15651 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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HMGN3Q15651 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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HMGN3Q15651 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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