Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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