Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RAB35Q15286 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RAB35Q15286 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms