Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KARSQ15046 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KARSQ15046 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KARSQ15046 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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