Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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CHD4Q14839 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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CHD4Q14839 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
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CHD4Q14839 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
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CHD4Q14839 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CHD4Q14839 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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CHD4Q14839 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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