Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SQLEQ14534 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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