Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ALCAMQ13740 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ALCAMQ13740 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ALCAMQ13740 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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ALCAMQ13740 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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ALCAMQ13740 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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ALCAMQ13740 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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