Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TUBB3Q13509 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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TUBB3Q13509 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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