Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms