Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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TOP3AQ13472 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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TOP3AQ13472 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TOP3AQ13472 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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TOP3AQ13472 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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