Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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