Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RIGQ13278 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RIGQ13278 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RIGQ13278 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms