Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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CBX3Q13185 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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