Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms