Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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NR1H3Q13133 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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NR1H3Q13133 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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