Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms