Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BPTFQ12830 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
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BPTFQ12830 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0□□□□□ -2.41
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BPTFQ12830 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
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BPTFQ12830 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
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BPTFQ12830 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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BPTFQ12830 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BPTFQ12830 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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