Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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