Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRMP28827 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
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