Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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