Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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ERVV-1B6SEH8 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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ERVV-1B6SEH8 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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