Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATG3Q9NT62 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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