Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GOPCQ9HD26 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GOPCQ9HD26 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms