Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD1Q9GZZ0 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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