Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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CCDC47Q96A33 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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CCDC47Q96A33 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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CCDC47Q96A33 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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CCDC47Q96A33 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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CCDC47Q96A33 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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CCDC47Q96A33 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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CCDC47Q96A33 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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