Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C6Q969F1 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GTF3C6Q969F1 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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