Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TMIEQ8NEW7 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TMIEQ8NEW7 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms