Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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USP43Q70EL4 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP43Q70EL4 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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