Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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PTPROQ16827 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PTPROQ16827 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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PTPROQ16827 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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