Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SGCBQ16585 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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