Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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TNXAQ16473 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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TNXAQ16473 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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