Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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