Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZFHX3Q15911 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms