Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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