Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SKIV2LQ15477 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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