Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
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SYCP1Q15431 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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