Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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