Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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